核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是指有单个核苷酸替代、插入或缺失而形成的分子形态。SNP是继微卫星之后的第三代遗传标记。单核苷酸多态性是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据,因此被广泛用于群体遗传学研究(如生物的起源、进化及迁移等方面)。SNP是人类基因组中数量最多的一种多态形式,人类基因组中总共有300万个SNP,平均每1000个碱基中就有一个SNP,有些SNP位点还会影响基因的功能,对它的研究将帮助我们在疾病相关基因定位,认识人种、人群、个体间的遗传差异,研究基因组结构,研究疾病或耐药性与个体差异的关系等领域进行深入的了解。
一. 项目内容:
二. PCR测序检测法:
PCR测序是SNP分型的金标准,直接对需要检测的位点进行扩增后测序,通过PCR测序法进行SNP分型检出率几乎为100%。纯合型SNP位点的测序峰图为单一峰型,杂合型SNP位点的测序峰图为套峰。
(1):实验流程:
(2):您需要提供的信息:
NCBI基因登陆号和rs号或物种信息,SNP位点及上下游至少200bp基因组DNA序列,并尽可能标注出范围之内的其他SNP位点。
(3):送样要求:
基因组DNA样品:DNA样品浓度≥50ng/ul,体积最少量为10ul并每增加一个位点增加2ul样品, A260/A280比值为1.8左右,送检DNA样品浓度稀释成相对一致。 血液样品:血液样本用EDTA抗凝剂的真空管采集或枸橼酸钠抗凝,采集后放入-20℃保存,体积大于1ml。
(4):我们可以提供的服务:
(5):结果展示:
(6):服务价格:
项目 | 内容 | 价格 |
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基因组DNA提取 | 全血样品的基因组DNA提取 | 20元/样本 |
位点预实验 | 确定位点PCR反应条件 | 300元/位点 |
位点扩增 | 根据预实验条件批量扩增 | 5-10元/扩增 |
测序检测 | PCR纯化后安排测序 | 同常规测序 |